主な機能

データ閲覧

ゲノムブラウザ上で大量シーケンスデータの解析結果(ゲノム再シーケンス、多型解析、遺伝子発現、ChIP-Seq、メチレーション解析等)を様々な形状(例:リードアライメント表示、リードdepthのグラフ/密度表示、多型のグラフ/密度/個別表示、ペアリードのダンベル表示など)で閲覧できます。(※1)
公共アノテーションを組み込んでご提供しますので、解析結果と比較しながらの閲覧が可能です。(※2)

データインポート

他の解析ソフトウェアからの出力データを取り込むことが可能です。(※1、3)
対応形式:SAM/BAM、GFF3、VCF、BedGraph

コメント追加

ゲノムブラウザ上で、任意の領域・項目(遺伝子などの公共アノテーション/解析結果データ)に対してコメントを追加できます。コメント文字列の検索も可能です。

ユーザ定義タグ追加/分類

ウェブブラウザからの操作で、任意の公共アノテーション・コメントにタグを追加することができます。
独自のタグが定義可能で、描画形状を指定しておくと、ゲノムブラウザ上で形状が反映されます。
タグを検索することができるので、後々のデータ整理が効率的に実施できます。

Workbench Mini:簡易解析機能(Genome Boxのみ)

Genome Boxでは、少量のfastq形式データのマッピングおよび、多型解析、タグカウントの簡易解析機能(Workbench Mini)が搭載されています
解析結果はゲノムブラウザにインポートし閲覧することが可能です。

※1 追加可能な解析結果データ量はディスク/USBメモリ容量に依存します。
※2 公共アノテーション付で提供可能な生物種/ビルドは随時追加予定。お急ぎ/未公開生物種の場合にはカスタマイズによるご提供も可能です。
※3 リファレンスゲノムデータが一致している場合に限ります。全ての解析ソフトウェアからの出力データ取り込みを保証するものではございません。

製品構成と主要機能

機能 Genome Box Genome Block Genome Stick
ゲノムブラウザ
ゲノムブラウジング
コメント・タグの追加・検索
プロジェクト管理機能
プロジェクトの追加・削除
トラックの追加・削除
ユーザ管理
簡易解析機能
マッピング × ×
多型探索 × ×
タグカウント × ×

※記載の内容はすべて2011年12月現在のものであり、変更される場合があります。(製品の価格についてはお問い合わせください。)/製品の仕様・外観は予告なく変更される場合があります。